Bệnh viện Thống Nhất là Bệnh viện đa khoa hạng I, trực thuộc Bộ Y tế, được thành lập theo Quyết định số 08-TTg/CP ngày 01/11/1975 của Thủ tướng Chính phủ với tên gọi Quân Y viện Thống Nhất do Bộ Quốc phòng quản lý. Năm 1978, được chuyển giao cho Bộ Y tế quản lý theo Quyết định số 45-TTg/CP ngày 25/3/1978 của Thủ tướng Chính phủ và được Bộ Y tế tiếp nhận đổi tên thành Bệnh viện Thống Nhất theo Quyết định số 553/QĐ-BYT ngày 11/5/1978 của Bộ trưởng Bộ Y tế. Hiện nay, Bệnh viện thực hiện chức năng, nhiệm vụ theo Quyết định số: 4609/QĐ-BYT ngày 07 tháng 10 năm 2019 của Bộ trưởng Bộ Y tế về việc ban hành Quy chế Tổ chức và Hoạt động của Bệnh viện Thống Nhất.

Bệnh viện được thành lập theo Quyết định số 417/QĐ-UB ngày 22/07/1977 với tên gọi Viện Điều Dưỡng Thành phố trực thuộc Sở Y Tế Thành phố Hồ Chí Minh. Ngày 10/03/1998 được đổi tên Bệnh viện Điều Dưỡng – Phục hồi chức năng – Điều trị bệnh nghề nghiệp theo Quyết định số 1231/QĐ-UB-NC. Ngày 25/12/2014 được đổi tên thành Bệnh viện Phục hồi chức năng – Điều trị bệnh nghề nghiệp theo Quyết định số 6373/QĐ-UBND.